Fakultas Agama Islam memiliki 3 program studi, yaitu Pendidikan Agama Islam (Tarbiyah), Ahwal Al-Syakhsiyyah (Syari'ah), dan Pendidikan Anak Usia Dini (PAUD). 

Program Studi Pendidikan Agama Islam dengan konsentrasi  Psikoterapi Islam dan Manajemen Pendidikan Islam dikelola secara khusus dan dipersiapkan untuk menghasilkan Sarjana Pendidikan Islam yang memiliki kemampuan konseptual, sekaligus potensial dan profesional sebagai Pendidik Agama Islam, Konsultan Psikoterapi Islam, Konselor Islam, Praktisi sekaligus Konseptor Manajemen Pendidikan Islam, Pengelola serta Guru Lembaga Pendidikan Anak Usia Dini (PAUD).

Sedang program studi Ahwal Al Syakhsiyyah dengan konsentrasi  Keperdataan Islam dikelola sedemikian rupa untuk menghasilkan Sarjana Hukum Islam yang mampu mengaplikasikan Islam dalam kehidupan bermasyarakat.

Proses pembelajaran di ketiga  program studi selain diorientasikan kepada penguasaan dan pengembangan teoritis dan nilai guna praktis juga diarahkan kepada kemampuan analisis dengan berlandaskan kepada ajaran agama

Kedepan, Fakultas Agama Islam akan membuka program studi baru yaitu Ilmu Al-Qur'an dan Hadist (Kelas Internasional Berbahasa Arab).

~ PRODI PENDIDIKAN AGAMA ISLAM ~

VISI

Mewujudkan program studi unggulan dalam bidang Pendidikan Agama Islam dan ilmu pengetahuan dan teknologi, berlandaskan Al-Qur'an dan Sunnah serta ijtihad dengan mengedepankan Trilogi Cokroaminoto yaitu : Sebersih-bersih tauhid, setinggi-tinggi ilmu, sepandai-pandai siasah.

MISI

Menyelenggarakan tridharma pendidikan tinggi bidang Pendidikan Agama Islam berlandaskan nilai-nilai Islam dan berwawasan global serta dapat memenuhi tuntutan perkembangan dan kebutuhan masyarakat.

TUJUAN

1. Terwujudnya sarjana Pendidikan Islam yang beriman, bertaqwa, berakhlaqul karimah serta memiliki kemampuan akademik dan profesional sebagai guru Pendidikan Agama Islam pada jenjang pendidikan menengah baik jenis pendidikan umum, kejuruan maupun keagamaan.
2. Terwujudnya pemimpin masyarakat (umat) yang beriman, bertaqwa, dan berakhalaqul karimah serta memiliki kemampuan mengerakkan umat ke arah kebaikan untuk kemajuan peradaban Islam dan masyarakat pada umumnya.

~ PRODI AHWAL AL-SYAKHSIYYAH ~

VISI

Mewujudkan program studi unggulan dalam bidang Hukum Islam khususnya Hukum Keluarga dan ilmu pengetahuan dan teknologi, berlandaskan Al-Qur'an dan Sunnah serta ijtihad dengan mengedepankan Trilogi Cokroaminoto yaitu : Sebersih-bersih tauhid, setinggi-tinggi ilmu, sepandai-pandai siasah.

MISI

Menyelenggarakan tridharma pendidikan tinggi bidang Hukum Islam berlandaskan nilai-nilai Islam dan berwawasan global serta dapat memenuhi tuntutan perkembangan dan kebutuhan masyarakat.

TUJUAN

1. Terwujudnya sarjana Hukum Islam yang beriman, bertaqwa, berakhlaqul karimah serta memiliki kemampuan akademik dan profesional sebagai hakim, na'ib, panitera, advokat, pakar falak dan profesi lain yang terkait dengan disiplin ilmu Hukum Islam.
2. Terwujudnya pemimpin masyarakat (umat) yang beriman, bertaqwa, dan berakhalaqul karimah serta memiliki kemampuan mengerakkan umat ke arah kebaikan untuk kemajuan peradaban Islam dan masyarakat pada umumnya.

Staf Pengajar

1. Drs. H. Mardzuki Rasjid
2. Dra. Hj. Rosnimar Djambak
3. Dra. Hj. Difla Nadjih, MS.
4. Dra. Hj. Siti 'Aisyah, M.Ag.
5. Drs. Sugianto, M.Si.
6. Drs. Hilman Harun
7. Drs. Muh. Nasrudin, M.Ag.
8. Drs. H. Syaripulloh, M.Si.
9. Drs. Taufik Nugroho, M.Ag.
10. Drs. Moh. Arwani, M.Ag.
11. Drs. Hakiki
12. Ismail, S.Ag., M.Ag.
13. Dra. Istifianah, M.Ag.
14. Drs. Nurdjidin, M.Si.
15. Drs. Hafizh A. Masro
16. H. Musthofa Ismail, MA., LLM.
17. Drs. H. Usman Saleh